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2015年,美国堪萨斯州立大学Palinski等通过宏基因组测序方法,从患有皮炎肾病综合征与繁殖障碍的猪群中检出了一种新型猪圆环病毒,并将其命名为猪圆环病毒3型(Porcine Circovirus type 3,PCV3),他们通过对源于爱荷华州、印第安纳州、墨西哥州、北卡罗来纳州、俄克拉荷马州等多个州的样品进行了血清流行病学和地理分布的回溯性研究,发现阳性率高达55%(46/83),这一结果表明PCV3在美国猪场流行比较常见。随后Stadejek等对波兰境内14个商品化猪场母猪、仔猪和育成猪血清作PCV3检测,首次证实欧洲地区存在PCV3感染。Kwon等对采自韩国6个省73个猪场的猪唾液样品作PCV3核酸检测,首次发现韩国猪群也存在PCV3感染与流行。2016年以来,我国湖北、湖南、广东等地从些发生繁殖障碍母猪以及急性死亡仔猪体内也检测出PCV3。以上研究表明PCV3作为一个新发现的病毒,流行的范围较广,对养猪业造成的危害较大。截至目前,我国已有13个省猪场存在PCV3感染与流行,但主要分布于中东部地区,为了解新疆地区是否存在PCV3感染,本研究根据PCV3 cap基因设计特异性引物,采用PCR方法对新疆某猪场疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)死亡仔猪病料样本进行PCV3检测,克隆扩增产物并进行核酸序列分析。结果在新疆某猪场5个疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征死亡仔猪的病料样本中检测到3个呈PCR阳性的样品,阳性率达60.00%。PCR扩增产物经克隆后测序获得3株PCV3cap全基因序列,分别命名为PCV3/CN/Xinjiang-2/2017、PCV3/CN/Xinjiang-3/2017、PCV3/CN/Xinjiang-4/2017。3个新疆株PCV3毒株的cap基因序列同源性分别在99.7%～99.8%之间;与PCV3/CN/Hunan-B8/2016株国内PCV3毒株和PCV3-US/MO2015株美国PCV3毒株的cap基因序列同源性分别在99.2%～99.7%和99.0%～99.5%,属于3b亚群。本研究首次在新疆地区疑似PMWS死亡仔猪病料中检测到了PCV3,证实了新疆猪群已存在PCV3感染,且属于3b亚群,为PCV3的流行病学研究提供数据。