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柑橘青苔病是一种普遍发生且为害严重的病害,本文对重庆地区受青苔侵染后的柑橘叶际生物多样性进行分析,旨在找到可能的病原物类群,为更好地防治柑橘青苔病奠定基础。本文利用Illumina Miseq高通量测序技术探索重庆地区有青苔病症和无病症的柑橘叶际真核生物的群落组成、结构及差异,利用mothur进行多样性指数分析,利用mothur做rarefaction分析及分类学分析,利用R语言工具制作曲线图等。结果表明13个柑橘叶片样本共检测到303个OTUs,多样性较为丰富;优势门为链形植物门Streptophyta、子囊菌门Ascomycota、绿藻门Chlorophyta和担子菌门Basidiomycota,优势纲为座囊菌纲Dothideomycetes、共球藻纲Trebouxiophyceae、散囊菌纲Eurotiomycetes、子囊菌纲Sordariomycetes、外担菌纲Exobasidiomycetes等;通过分析发现可能的病原物为uncultured Apatococcus(不可培养的虚幻球藻)、Heterochlorella luteoviridis(绿藻)、Cyphellophora sessilis、Heveochlorella hainangensis(海南橡胶藻)、Coniochaetales sp.GMG C4、Chloroidium ellipsoideum(椭圆球藻)、Kalinella bambusicola、Colletotrichum gloeosporioides(胶孢炭疽菌)等;不同区县表现出青苔病症状的柑橘叶片上疑似病原物的种类和丰度都差异很大。柑橘青苔病的发生可能是由多种藻类及真菌复合侵染造成的,健康及患病柑橘叶片间的相互作用有待进一步研究。