近年来，我国改革开放不断深入、经济社会快速发展、城镇化水平不断提升，各种基础设施的不断建设，导致各种地下遗址和文物的发现，配合基础设施建设的考古发掘也不断增多。如何对这些被发现的具有珍贵历史价值和意义的考古遗址进行保护，是需要考虑的重要问题之一。而考古遗址博物馆的建立就是保护遗址及遗址出土的文物。考古遗址博物馆是建立在考古遗址基础之上的博物馆，以保护、发掘、展示为主要功能，它具有强大的社会价值，是宣传我国的历史、考古成就，培养人们的爱国主义精神的大课堂，是我国珍贵的文化遗产之一。对其保护利用的对策应坚持“保护为主，合理利用”的指导思想，深入研究考古遗址博物馆的特点及其社会等价值，深刻理解和认识考古遗址所包含的历史、科学、文化思想。通过原真性、可持续性、动态性的保护原则和对策的实施，以及旅游市场的开发、基础设施、娱乐设施的完善，使考古遗址博物馆发挥更大的社会价值、科研价值。