【摘 要】
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传染性造血器官坏死病病毒(IHNV)是一种严重威胁虹鳟及其它鲑科鱼类的病毒。主要组织相容性复合体(MHC)基因的多态性与疾病的抗性和易感性密切相关。本研究采用聚合酶链式反
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传染性造血器官坏死病病毒(IHNV)是一种严重威胁虹鳟及其它鲑科鱼类的病毒。主要组织相容性复合体(MHC)基因的多态性与疾病的抗性和易感性密切相关。本研究采用聚合酶链式反应-单链构象多态性及克隆测序的方法,检测了104尾抗病虹鳟个体和91尾易感虹鳟个体的MHC Ⅱβ基因(DAB)第2外显子多态性,并分析了其与抗IHNV相关性。结果共检测出45个不同的DAB基因第2外显子等位基因,其中有30个为首次发现。个体所拥有的等位基因数为1~4个不等,预示虹鳟DAB基因至少存在2个拷贝位点。MHC分子抗原肽结合区(PBR)和非抗原肽结合区(non-PBR)的氨基酸序列变异百分率分别为66.67%和45.28%。非同义替换率dN极显著地高于同义替换率dS(P<0.001),说明平衡选择维持了虹鳟DAB基因外显子2的多态性。抗病相关性分析表明,等位基因Onmy-DAB*0201(P<0.001),Onmy-DAB*0904(P<0.001)和Onmy-DAB*1102(P<0.01)与IHNV易感性相关,而Onmy-DAB*0103,Onmy-DAB*0601和Onmy-DAB*1402与IHNV抗性高度相关(P<0.001,这些等位基因可作为分子标记辅助选育抗IHNV虹鳟品系。
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