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西太平洋边缘,白垩纪以来,经历一系列的俯冲碰撞以及拉张、裂谷至海底扩张的事件,形成现在东南亚大陆边缘构造特征.马鲁古海是双向汇聚带，马鲁古海板块往东下插于哈马黑拉之下，往西下插于桑义赫弧，形成反u形双向俯冲带，洋壳已消亡，其两侧的哈马黑拉与桑义赫弧已于晚上新世开始碰撞。马鲁古海东南为北西西的新几内亚岛弧，该段既有剪切边界，又有俯冲边界，剪切作用明显，带有剪切拉张盆地。