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正确认识和理解方-证对应关系是现代中医药研究的重大科学问题。只有从根本上彻底阐明方-证关系，才能了解中医理、法、方、药等理论的科学内涵。考虑到方剂的多成分、多靶点及多途径的特点，方-证关系研究应该明确多成分-多靶标间的相互作用。本文以中药复方丹参方抗动脉粥样硬化作用为例，以有效成分与作用靶标的分子间相互作用为研究切入点，系统考察了复方丹参方治疗血瘀证的分子机理，构建了复方丹参方活血化瘀作用“化学成分-作用靶标”网络图。