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目前为止,蔷薇类植物目级水平的关系没有很好解决。基于叶绿体,线粒体和核基因的研究产生矛盾的结果,使之成为近年来广泛关注的被子植物系统发育学问题。数据和方法：这里,共有96个单拷贝核基因从KOG (eukaryotic orthologous groups)数据库中鉴别,大多数第一次用于被子植物系统发育分析。来自完成测序的蔷薇类植物的直系同源数据集被装配用于蔷薇类植物的COM分支(Celastrales,Oxalidales,Malpighiales)位置的分辨。