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抗战时期，中央地质调查所内迁重庆北碚，中国西部科学院帮助其在纷乱的战时安定下来，开始了特殊历史时期的的大后方科学研究工作，使得地质学等科学研究的科研血脉没有中断、得以传承。地质所的主要工作是在两部地区开展调查、从事科研，此外还积极参与当地的社会发展建设，为抗战做出了卓越出贡献。这段时期形成了一段中国地质发展的特殊历史，具有重要的历史科学意义。