响应黄瓜绿斑驳花叶病毒侵染的黄瓜miR159靶基因鉴定和功能预测

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黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)是帚状病毒科(Virgaviridae)烟草花叶病毒属(Tobamovirus)成员,近年来已在我国多地传播蔓延,严重影响葫芦科作物的产量及品质。由于病毒基因变异频率高、变异速度快,存在抗病品种的抗性易丧失等问题,因此病毒病较难防治。MicroRNA (miRNA)作为植物内源非编码的小RNA分子,在植物生长发育、抵御逆境胁迫及响应病原物侵染过程中发挥重要的调节作用,因此,鉴定受miRNA调控的靶基因并研究miRNA在植物与病原物互作过程中的作用具有重要意义。研究团队前期试验结果表明,在黄瓜与CGMMV互作过程中,miR159通过指导剪切或翻译抑制发挥其对下游靶基因的负调控作用;此外,通过降解组测序鉴定了响应CGMMV侵染的黄瓜miR159的3个靶基因XM004140579.2、XM004140875.2和XM011658282.1,生物信息学分析结果表明其均为MYB类转录因子,可能在黄瓜抵御CGMMV侵染过程中发挥重要调控作用。本研究以中农16号黄瓜的3叶期幼苗为试验材料,将CGMMV接种20d后的黄瓜叶片样品采用Trizol法提取总RNA,采用5′-RLM-RACE方法验证了miR159对上述3个靶基因的剪切作用并计算其剪切效率,结果表明:miR159在其5′端的第10位核苷酸处对其靶基因XM004140579.2、XM004140875.2和XM011658282.1进行特异性剪切,切割频率分别为23/25、37/38、25/39,据此认为miR159通过剪切作用负调控可能与抗病相关的靶基因。后续研究将通过miR159的过表达或抑制表达试验,揭示miR159在黄瓜-CGMMV互作过程中的具体功能,为黄瓜抗绿斑驳花叶病毒的分子机制研究提供理论参考。
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