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驴繁殖障碍性疾病,主要由子宫内的细菌感染造成的,是规模化驴场最重要的疾病之一。为了研究驴子宫内的细菌组成变化与繁殖障碍性疾病的关系,使用高通量测序对3～5岁成年母驴(n=11)的子宫内容物提取基因组DNA,对平均437bp的16s rDNA V3-V5区进行扩增和测序,对细菌多样性进行分析。结果显示子宫内共检测到511种细菌操作分类学单位(OTU),属于21门,35纲,73目,132科,273属和380种。整体上优势菌(数量较多,占据主导地位的菌种)是紫单孢菌科(22.35%)、梭杆菌科(10.81%)和棒状杆菌科(6.48%)。其它科细菌种类较少,丰度不足1%的细菌所占比例高达15.89%。屡配不孕(Sterility,n=3)组中卟啉单胞菌属(18.1%)、棒状杆菌属(10.5%);弯曲菌属(9%)属于优势种群。子宫炎(Metritis,n=4)卟啉单胞菌属(Porphyromonas,18.6%),棒状杆菌属(Corynebacteriaceae_unclassified,7.56%),拟杆菌属(Bacteroides,5.19%)属于优势菌种。健康驴(health,n=4)组细菌种类分布较为均匀,优势菌为卟啉单胞菌属(24%)、纤毛菌属、(8.37%)、棒状杆菌属(8.03%)、二氧化碳噬纤维菌属(7.5%)和弯曲菌属(6.84%)。Metritis组的细菌种类组成离散度明显高于其它两组,与其它两组的组成距离较远,其优势菌群结构与其他两组存在显著差异。这一发现可以为子宫炎病例的诊断作参考。这表明引起母驴繁殖障碍性的各种病因中,细菌群落是相当复杂的并且具有相当的差异性,是否发挥了决定性作用尚不能确定,但是有若干种细菌属于潜在的造成母驴繁殖障碍的危险因素。