细粒棘球绦虫是一种重要的人兽共患寄生虫。为了解青藏高原地区细粒棘球绦虫的遗传变异情况，为细粒棘球蚴病的防治提供基础材料。本研究基于cox1基因全序列(1609bp)分析青藏高原地区47个细粒棘球蚴分离株的序列变异情况，并结合NCBI数据库已公布的我国青藏高原和中东地区所有cox1基因全长序列，对比两个种群的遗传多态性特征。结果显示：47个样品均被确定为G1基因型，分为10个单倍型(C1-C10)，其中优势单倍型C1与中东优势单倍型相同，且该单倍型呈世界分布。我国青藏高原地区单倍型多样性(Hd)与核苷酸多样性(π)较低，明显低于中东种群，两个地区Tajimas D和Fus Fs检验值均为负值，遗传结构差异不显著。研究结果表明：我国青藏高原细粒棘球绦虫可能是由一个起源于中东的有效种群进入该地区后，经历了近期群体扩张或遗传瓶颈，在高原地区天然的地理隔离作用下，逐渐发展成了现在的种群。