谷瘟病是由灰梨孢菌Magnaporthe oryzae引起的,是谷子生产中重要流行性病害之一,严重时可造成大面积减产甚至绝收,抗性品种的选育与推广种植是防治谷瘟病最经济有效的方法。谷瘟病菌的无毒基因与谷子抗病基因互作与稻瘟病菌和水稻抗病基因互作相同,都遵循基因对基因假说。田间谷瘟菌株无毒基因的变化常常使寄主抗病性丧失,因此鉴定各地区谷瘟病菌群体包含的无毒基因类型,了解谷瘟病菌无毒基因的分布及变异情况,可为深入研究谷瘟病菌群体遗传结构及其无毒基因变异机制奠定基础。PWL基因家族作为寄主特异性无毒基因,是谷瘟病菌无毒基因的重要组成部分,至今,关于我国谷瘟病菌中PWL无毒基因家族分布和变异未见报道。为了解无毒基因PWL家族在谷瘟病菌群体中的分布和变异情况,本研究利用5对特异性引物对252株谷瘟病菌单孢菌株进行扩增及测序分析。以252株谷瘟病菌单孢菌株DNA为模板,利用设计的5对PWL无毒基因特异性引物进行PCR扩增,扩增结果表明:PWL基因家族在谷瘟病菌中存在变异,变异的形式主要为基因的缺失和插入。谷瘟病菌未能扩增出PWL1基因的特异性目的片段,说明谷瘟病菌菌株均不含有PWL1基因。共65个谷瘟病菌菌株扩增出无毒基因PWL2的特异性目的片段,扩增率为25.8%。而无毒基因PWL4和PWL3扩增率均为100%,但谷瘟病菌与稻瘟病菌相比PWL3基因均存849bp碱基的插入。利用谷瘟病菌与稻瘟病菌PWL3基因的差异可通过PCR技术快速区分谷瘟病菌与稻瘟病菌。PWL2基因存在单核苷酸变异,共划分为14个单倍型,单倍型P1为绝对优势单倍型。谷瘟病菌无毒基因PWL家族成员分布及变异分析对于深入研究谷瘟病菌群体遗传多样性,及谷瘟病菌与寄主谷子之间的互作机制开展研究具有重要价值。