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目的:建立气相色谱质谱联用技术的慢性牙周炎血清和龈沟液的代谢组学研究方法及数据模型,筛选慢性牙周炎的特异性代谢标志物,为慢性牙周炎发病机制和临床早期诊断提供新的理论依据。方法:在牙周病科门诊收集20例重度慢性牙周炎患者及20例健康对照者的血清及龈沟液标本,采用含1%三甲基硅烷的N-O-双(三甲基硅基)三氟乙酰胺进行衍生化和GC-MS分析。对分析之后产生的信息进行数据提取、消除干扰因素和模式识别,建立正交偏最小二乘法(OPLS-DA)模型筛选能有效表征的差异性代谢物,并通过Fiehn数据库进行鉴定。结果:采用GC-MS分析的代谢组学研究方法检测了两组人群血清样本,共定性200个内源性代谢物;OPLS-DA分析提示,慢性牙周炎组与健康组相比,谷胱甘肽、去甲肾上腺素、尿黑酸、2’-鸟嘌呤脱氧核苷等在血清中的含量较健康组低,而尿素和异肌醇较高,上述代谢物主要与氧化应激、嘌呤代谢和酪氨酸代谢有关。采用GC-MS分析两组人群龈沟液样本,共定性349个内源性代谢物;OPLS-DA分析提示,慢性牙周炎组与健康对照组相比,谷胱甘肽和胸苷的含量较健康组低,黄嘌呤、脱氢抗坏血酸、维生素E、β-丙氨酸、尿苷、丙二酸盐、葡萄糖醛酸、5-磷酸核酮糖以及果糖-6-磷酸较高。上述代谢物主要与氧化应激和嘧啶代谢有关。结论:基于GC-MS的血清及龈沟液代谢组学方法能够区分重度慢性牙周炎与正常健康人群;氧化应激、酪氨酸代谢、嘌呤代谢和嘧啶代谢与慢性牙周炎具有一定联系。