【摘 要】
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毒素的单链抗体免疫检测是一种高效且安全的检测方法。我们应用分子模拟技术,采用同源模建及分子动力学方法,构建并优化实验获得的新型蓖麻毒素单链抗体Scfv-16三维结构,结合
【机 构】
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北京药物化学研究所国民核生化灾害防护国家重点实验室;
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毒素的单链抗体免疫检测是一种高效且安全的检测方法。我们应用分子模拟技术,采用同源模建及分子动力学方法,构建并优化实验获得的新型蓖麻毒素单链抗体Scfv-16三维结构,结合Profile-3D和拉氏图方法,评价单链抗体三维结构与其一维序列的兼容性和模型的合理性。对蓖麻毒素单链抗体Scfv-16,进行重链、轻链、CDR区的预测研究,同时对蓖麻毒素A链进行构象表位预测和结构功能分析。利用蛋白-蛋白分子对接方法研究单链抗体Scfv-16与毒素的识别及相互作用模型。结果表明,蓖麻毒素A链具有13个可能的构象表位,毒素结合到单链抗体的重链上,毒素与单链抗体Scfv-16分子识别,主要是蓖麻毒素A链的第7、8表位的残基,与单链抗体重链的CDR2区的残基,形成氢键、π-π相互作用和疏水作用。本研究为该毒素抗体的结构设计提供了重要的线索和理论依据,对多肽毒素新型抗体的研究和开发具有理论指导价值。
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