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当前我国区域创新体系普遍存在为各区域创新主体缺乏有效的连接导致的“系统失灵”,主要表现为技术创新执行链断裂、现有地方综合科研机构定位模糊、政府缺乏落实和执行产业科技政策的有效载体、地方综合科研机构的作用没有充分发挥等。针对这些问题,从国家创新体系、区域创新体系和技术创新过程三个视角论证了地方综合科研机构应有的定位及作用,由此提出了一个以地方综合科研机构为中枢节点,联结官产学研,辅助产业科技政策落实,整合国内外创新资源,促进产业创新的区域创新系统运行机制模型。