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我国拥有丰富的兔品种资源,獭兔产业在国内家兔市场上占有很重要的经济地位。但是獭兔毛色单一、染色成本高且易造成污染等制约了獭兔的发展。为了能够培育出更稳定、更易控制的毛色性状,对獭兔毛色基因的开展初步研究。本实验主要研究MC1R基因多态性与獭兔毛色的关系。实验根据NCBI数据库家兔MC1R基因的编码序列设计引物,利用PCR技术,对余姚欣农兔业兔场的16只獭兔MC1R基因外显子进行克隆测序,得到外显子基因编码序列,并测序;运用Clusta1X2、Bioedit等软件对序列进行比对,对MC1R基因进行多态性分析和比较。结论:海狸色、黑色獭兔在MC1R基因扩增片段2上存在A→G碱基突变,这个位点具有成为獭兔毛色性状分子遗传标记的可能性。借助于分子生物学技术可以直接研究表型数量性状的位点(QuantitativeTraitLocus,QTLs),在DNA水平找到与数量性状相连锁的主基因或与其紧密连锁的分子标记,许多毛色性状为数量性状,其遗传基础受到多基因控制,存在主基因效应,分子生物学的发展和较高密度基因图谱的构建,使人们可以在DNA水平寻找控制毛色性状的主基因或与其紧密连锁的分子标记【12-16】。由于本研究的样本含量较少该突变对獭兔毛色性状的具体影响,有待进一步的研究。该位点具有成为獭兔毛色性状标记辅助选择的遗传标记的可能性,可考虑将MC1R基因作为影响獭兔毛色性状的候选基因。从本实验的结果可以得出以下的结论:(1)海狸色、黑色獭兔MC1R基因扩增片段2存在A→G碱基突变,说明A→G碱基突变与深色毛色性状有关。以及獭兔MC1R基因扩增片段3存在AGACGG的插入,可能与兔子的品种有关。(2)本实验所得的变异位点与参考文献中家兔上己扩增的片段不同,说明不同的种群中有不同的突变率。动物毛色发生变化是一个复杂的过程,受到一系列因素的影响,至今没有一个恰当理论完全合理的解释被毛颜色形成和改变的调控机理。为了能够培育出更稳定、更易控制的毛色性状,需更科学、效率地掌握獭兔毛色发育机制,从基因入手,进行科学地选种选育,提高生产经济效益。