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本文阐述了引入网络药理学概念和方法进行中药复方作用机理的研究进展，并指出已纳入国家自然科学基金优先资助范围。从中医药特色角度来说，使用“整体药理学”一词更合适。“整体药理学”实际上包含了二个复杂系统及其相互关系的概念，即外部的中药调节系统(方剂的整体效应分子组)和机体内部的应答系统(应答分子组或所谓的靶标系统)。因此，中医的“证”也可以被为是机体状态的“网络失衡”，而方剂的作用则是对失衡网络的整体调节，使之恢复整体平衡，即阴阳平衡。