目的:人参皂苷可抑制肺癌、乳腺癌、宫颈癌等肿瘤细胞的增殖、侵袭和转移。但目前关于人参皂苷Rd抑制口腔鳞癌作用效果的报道极少,其作用分子靶点尚不清楚。本研究通过全转录组测序分析,推断人参皂苷Rd对口腔鳞癌的作用机制。方法:随机选取6例口腔鳞癌患者,分别将同一患者口腔鳞癌组织和正常粘膜组织蛋白酶水解,并与人参皂苷Rd共培养,再进行全转录组测序分析,运用生物信息学分析推测人参皂苷Rd对口腔鳞癌的作用分子靶点。结果:人参皂苷Rd的IC50作用浓度为131umol/L。共有10674个基因被纳入差异表达分析,口腔鳞癌组与对照组之间差异基因716个,其中上调基因549个,下调基因167个。差异上调基因涉及230个GO和15个KEGG通路,差异下调基因涉及255个GO和18个KEGG通路。上调的KEGG中仅MicroRNAs in cancer与癌症相关,但该KEGG通路中的基因在GO中未映射,其具体机制尚不清楚。在18个下调KEGG通路中,有4个与癌症相关,即T cell receptor signaling pathway、Cell cycle、FoxO signaling pathway、Insulin signaling pathway。在这4个KEGG通路中,PDK1、GSK-3β、EP300明显下调,并均映射至多个GO。结论:人参皂苷Rd主要通过下调GSK-3β、PIK3R3、EP300等靶基因,发挥对口腔鳞癌的抑制作用。本研究结果表明人参皂苷Rd可作为潜在的口腔鳞癌靶向治疗药物,并为其进一步研究提供实验基础。