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SNP(single nucleotiie p0Iymotphism，单核苷酸多态)在猪基因组中的分布极其广泛，平均分布间隔为300-400bp，相关数据库收录已达55万条。猪基因组测序已取得实质性进展，大规模搜索发现基因组及EST(cxprcssed sequence tag)序列中的SNP已展开，应用于猪全基因组水平的SNP芯片已建立。在此基础上，基于猪SNP标记的遗传图谱绘制、QTL(quantitativetrait loci)定位，遗传多样性检测及全基因组关联分析等也都相继出现。