【摘 要】
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基于现有全基因组序列,研制了鼠疫耶尔森氏菌全基因组DNA芯片,进行了数十株鼠疫耶尔森氏菌株和假结核耶尔森氏菌的比较基因组杂交,分析了各基因在不同菌株间的差异分布,由芯
【机 构】
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军事医学科学院微生物流行病研究所,全军微生物检验研究中心,国家生物医学中心分析微生物实验室(北京)中国科学院北京基因组研究所(北京)青海省地方病防治研究所(西宁)
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基于现有全基因组序列,研制了鼠疫耶尔森氏菌全基因组DNA芯片,进行了数十株鼠疫耶尔森氏菌株和假结核耶尔森氏菌的比较基因组杂交,分析了各基因在不同菌株间的差异分布,由芯片杂交结果圈定了靶标基因,扩大菌株范围进行了大规模PCR验证,得到如下结果:探明了各基因组在鼠疫菌和假结核菌间的差异分布,探究了鼠疫菌的起源进化;在基因组上鉴定了数十个差异区段(DFR),根据各菌株的DFR图谱,建立了鼠疫菌基因组分型系统;建立了各基因组型别间的系统发育关系,揭示了鼠疫菌基因组的进化规律及其与鼠疫菌生态位适应和鼠疫疫源地扩展之间的关系,探明了鼠疫菌在中国的演化规律.
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