CHV1病毒的群体多样性研究对于栗疫病的生物防控具有巨大的理论和实践价值,中国是推测的CHV1病毒起源地,但关于中国CHV1病毒群体多样性的相关研究却相对匮乏。本研究对来自中国东部各地和日本的30个CHV1病毒进行了多区段的部分基因组序列测定和系统发育分析,发现中国的CHV1病毒具有较欧洲和日本更为丰富的遗传多样性,在之前已鉴定的6个欧洲CHV1病毒亚型的基础上,从亚洲东部鉴定出8个新的CHV1病毒亚型。挑选分属8个新鉴定亚型的15个代表性菌株进行了基因组全长测序,结合已报道的6个欧洲亚型的12个CHV1病毒的全长基因组序列,进行了系统发育和重组分析。依据全长基因组序列信息所绘制的系统发育树表明,东亚地区的CHV1病毒与欧洲CHV1病毒遗传差异明显,且多样性更为丰富;欧洲的6个亚型在系统发育树上分为2簇且聚集在一起,提示其具有较近的亲缘关系;只来自中国的亚型CN6与欧洲CHV1病毒的亲缘关系相对较近,但仍位于欧洲整体分支的外部,其他7个东亚亚型与欧洲CHV1病毒亲缘关系相对较远。基于27个CHV1病毒全长基因组序列的重组分析表明,CHV1病毒间存在着广泛的基因组重组现象。部分重组事件涵盖一个或多个亚型,提示这些重组事件可能发生在亚型分化之前,部分重组事件只发生在某些亚型内的部分成员上,提示是较近时期才发生的重组事件。基于基因组核酸序列的病毒进化分析可能会受到重组所造成的信号干扰,造成分析结果的错误和不准确。本研究中,去除各个病毒基因组中的重组区段之后,用各个病毒的剩余主要基因组序列成分,重新进行了系统发育分析,发现此系统发育树与基于全长基因组序列所绘制的系统发育树相比,其拓扑结构未发生根本性的变化,但各分支更加明晰,支持度大为提高。