中国湖泊富营养化进程加快，其中相当部分湖泊发生蓝藻爆发。“水华”、蓝藻爆发的含义有所不同，蓝藻爆发危害严重。治理湖泊蓝藻爆发已成为世界性难题。富营养化湖泊蓝藻爆发程度不同，年年大爆发或爆发频次低，也有不爆发。其原因是入湖污染负荷、富营养化、蓝藻种源种群、生物种间竞争、气象水文、水动力、换水次数、底泥、湖泊形状、水利工程、水生态系统受损程度等情况不同。采用综合性措施治理，五里湖、西湖、玄武湖、洱海、太湖、东湖等湖泊湖湾取得消除或大幅度减轻蓝藻爆发的良好效果。总结治理经验，提出太湖巢湖滇池蓝藻爆发治理和生态修复的总体思路：治理湖泊首先要治理蓝藻爆发，最终建成健康的水生态系统；削减蓝藻数量与治理富营养化相结合；削减蓝藻数量大于蓝藻自然增殖量；各类工程技术措施和相应的保障措施科学结合和正确衔接。