植物DNA条形码在植物物种的准确鉴定以及系统发育研究方面具有重要的价值。禾本科物种丰富,包含大量的粮食作物与能源作物,具有较高的经济价值和生态价值。目前,在植物中应用最多的matK、rbcL等通用DNA条形码在禾本科中的分辨率较弱,不能区分所有的物种,本研究旨在开发禾本科专一的DNA条形码,为禾本科的物种鉴定及其种间关系的研究提供帮助。本研究分析了GenBank数据库中禾本科叶绿体基因片段序列72375条,叶绿体基因组序列1350条,补充测定了蒲苇与柳叶箬的叶绿体基因组序列2条;运用DNAsp软件以及构建系统发育树的方法筛选高分辨率的叶绿体基因片段,对这些高变基因片段和通用基因片段matK、rbcL、trnH-psbA、trnL-F、ITS设计特异性引物;选取禾本科植物材料,通过实验检验引物的通用性。结果筛选出高分辨率基因片段ccsA、ndhF、psbE-petL、rpl16-rps3、rpl32-trnL、rps16总计6段,设计出特异性引物总计14对;经实验验证,引物的通用性良好。总的来说,本研究开发的高分辨率基因片段与设计的特异性引物可在禾本科的物种鉴定、禾本科的系统发育关系研究等多个方面发挥重要的作用。