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X射线脉冲星导航技术的核心问题是要在航天器上搭载大面积的X射线探测器，俘获来自脉冲星的1～10 keV的脉冲X射线，但是航天器所在的深空环境中存在着初级宇宙射线等高强度的本底辐射，其注量率可大于来自脉冲星的1～10 keV的x射线10个量级，这就要求我们的X射线探测单元能够在复杂背景下提取有效信号，这也是日前限制脉冲星导航技术进展的关键问题之一。本文在分析产生干扰信号的粒子种类及能量范围的基础上，提出从探测器结构出发采用多重反符合结构将干扰信号反符合掉，并设计了一种“时幅单道(TASCA)+时间数字转换器(TDC)”的信号甄别电路实现主探测器输出信号的甄别，从而实现降低本底干扰提高深空低能x射线探测效率的目的。