鱼类早期生活史阶段是鱼类资源补充过程的一个重要环节,对其展开研究,对鱼类资源的保护及合理开发与利用具有极其重要的意义。整个南海拥有鱼类记录已超过3410种,而世界可供参照的相关仔稚鱼形态分类图鉴不到700种,鱼卵不足200种,加之鱼类早期生活史过程的形态动态变化,对其进行正确的分类鉴定非常困难。本文基于DNA条形码技术,利用2012年-2015年南海北部各海域底拖网、灯光罩网17个航次累计下网1600余网次获得的鱼卵、仔稚鱼样品以及成鱼标本,累计测通鱼类CO1基因片段3100余条,种类510余种;测序仔鱼和初期稚鱼甲醛样本2100余尾,成功测出762个,其中测通755个,单向7个。鉴定出仔稚鱼213种类,隶属18目71科133属,其中鉴定到种152种,占比71.36%;到属57种,到科4种,占比28.64%;鱼卵测序202个,成功率为0。随着鱼类DNA Barcoding数据库的进一步完善与校正,利用CO1条形码进行仔稚鱼分类鉴定,具有广阔的应用前景。