【摘 要】
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GALAMOST是一个多功能的分子动力学模拟程序包[1],它被设计成尽可能多地利用GPU的计算效能。除了普通的分子动力学模拟的功能外,它被发展成为一个可以针对高分子体系进行
【机 构】
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中国科学院长春应用化学研究所,长春市人民大街5625号,130022吉林大学理论化学研究所,长春市朝阳区柳条路2号,130023
【出 处】
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2014年大分子体系理论、模拟与计算研讨会
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GALAMOST是一个多功能的分子动力学模拟程序包[1],它被设计成尽可能多地利用GPU的计算效能。除了普通的分子动力学模拟的功能外,它被发展成为一个可以针对高分子体系进行粗粒化分子动力学模拟的工具。它包含了一些最新报道的模拟技术,比如杂化粒子场分子动力学方法[2]、反向迭代波尔兹曼数值势方法[3]、软的各向异性粒子模型[4]、以及链增长聚合反应模型等[5]。通过不断地优化算法,程序包含的每种方法都在GPU上取得了很好的运算效率。此外,程序包还包括布朗动力学和耗散粒子动力学等程序模块。通过在GPU上运行这些先进的模拟技术,GALAMOST为研究人员提供了研究高分子体系的高效率的计算机模拟工具。
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