副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus,Vp)存在于海洋和淡水环境中,对水产养殖和人类健康构成严重威胁。为了比较Vp通过浸泡和尾静脉显微注射的方式感染斑马鱼所引起的天然免疫应答的差异,实验利用Vp13菌株通过浸泡和尾静脉显微注射感染受精后3天的斑马鱼幼鱼,并通过转录组和qRT-PCR进行分析。结果显示,使用各自的LD50感染剂量的Vp感染2h后可以激活斑马鱼的天然免疫应答,并且免疫相关基因tnfb和ccl20a.3在两组中均显著上调;通过转录组数据分析,我们推测浸泡感染可能最先影响背侧决定、细胞色素和脂肪酸结合蛋白以及炎症反应等过程,而显微注射感染可能主要直接影响细胞因子活性、细胞因子受体结合等免疫应答反应;通过qRT-PCR验证差异基因表达的结果与转录组结果相一致。该研究为探究不同感染途径对斑马鱼天然免疫应答的激活,并为进一步分析免疫应答信号传导途径提供了基础。