岩羊(Pseudois nayaur)隶属于羊亚科、岩羊属,目前仅包含一个物种,即岩羊.此外,在四川省以及云南省部分地区还生活着一群形态特异的岩羊群体——矮岩羊,它们与岩羊相比最明显的特征之一就是体型仅为岩羊的一半大小.自从矮岩羊被发现以来,其系统进化地位一直成为学者们争论的焦点,它属于一个新种、新的亚种还是隶属于四川亚种,仍然没有定论.本研究测定了西藏岩羊、宁夏岩羊和四川岩羊的线粒体全基因组,其长度分别为16,700bp、16,975 bp和16,738 bp.岩羊属各物种线粒体全基因组均包含有13个蛋白编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个控制区(D-loop),以及其密码子的使用频率均为典型的哺乳动物模式；岩羊属各物种线粒体基因组DNA的相似性为96.52-98.02％,其13个编码基因对应的氨基酸全序列之间的相似度为98.24-99.13％,四川岩羊与矮岩羊无论是在核菅酸同源性还是氨基酸同源性方面,都高于岩羊属其它物种,而四川岩羊、宁夏岩羊与西藏岩羊相互之间没有明显差异,这些与遗传距离结果均揭示四川岩羊与矮岩羊亲缘关系最近.