珍珠鸟、火鸡和红原鸡基因组微卫星比较分析

来源 :中国西部动物学学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yuhaolf
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:利用生物信息学的方法研究了斑胸草雀(Taeniopygia guttata)、火鸡(Meleagris gallopavo)和红原鸡(Gallus gallus)基因组微卫星的组成特征.结果表明,珍珠鸟、火鸡和红原鸡微卫星数目为272794、177733 和282728,微卫星序列总长占基因组总长的比重分别为0.437%、0.280%和0.487%,它们最长的微卫星分别是(CTAACC)63、(AGAA)122 和(A)773.珍珠鸟、火鸡和红原鸡基因组中,外显子区域微卫星总数为36582、25284 和46474,内含子区域微卫星总数为870、565 和1305,基因间区微卫星总数为235312、151842 和234834.三种鸟类中微卫星密度和分布频率最高的是红原鸡,珍珠鸟次之,火鸡最低.六碱基重复类型丰度最高的是珍珠鸟,其余重复类型丰度最高的则是红原鸡.
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