玉米种子低温萌发全基因组关联分析

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玉米是起源于热带亚热带地区的典型喜温作物,对低温较为敏感。在萌发阶段遭遇低温胁迫不但会降低玉米种子的出苗率和幼苗活力,还会增加被土壤病原菌侵染的几率,严重影响玉米产量。在10℃和25℃条件下分别测定了368份玉米自交系的低温发芽率和标准发芽率,利用分布于玉米全基因组的55万个单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism;SNP)标记对相对低温发芽率进行全基因组关联分析(Genome-wide association study;GWAS),共获得32个显著的SNPs(P<0.0001)。全基因组关联分析可以快速有效地获得与玉米低温萌发特性显著关联的位点和候选基因,为相关基因的克隆与转化奠定基础,提高玉米的低温抗性;为研究玉米萌发阶段响应低温的分子机理提供帮助。
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