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陕西商南金丝峡国家地质公园地处扬子板块北端与秦岭微板块的南端,其基岩兼具华北板块南缘与扬子板块北缘的性质,公园区内系统、完整、齐全的隘谷—嶂谷—峡谷地貌系统,多期溶洞,多级瀑布等珍贵地质遗迹分布在南北过渡带区域的地质构造部位,所以公园内部形成各种各样具有过渡性质的地质遗迹.这有利于对秦岭特殊部位的嶂谷地貌的形成与演化进行科学研究,对揭示和深化认识陕西秦岭东部的地质发育史、岩溶峡谷地貌发育史等都具有科学研究价值.同时,其岩溶峡谷地貌类型、规模在全国具有典型意义,而且对发展地质旅游、进行科学考察和科普教育亦具有重要意义.