小麦近等基因系TcLr19及其感病突变体与叶锈菌互作的转录组分析

来源 :中国植物病理学会2016年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liongliong591
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  小麦抗叶锈病基因Lr19具有很强的抗叶锈性,目前很少发现对其有毒力的小麦叶锈菌,克隆该基因,研究其抗病机制对于该基因的高效利用具有重要意义.利用基因突变群体进行分析是分离鉴定功能基因的重要途径.为了解Lr19的结构和功能,本研究以近等基因系TcLr 19以及其EMS诱导的感叶锈病突变体MuTcLr19 M2-6为材料,利用转录组测序技术分析和比较了野生型和突变型TcLr19在叶锈菌侵染0、24、144h (hpi)的差异表达基因.<忽略>=借助Gene Ontology (GO)数据库、KEGG pathway数据库对差异表达基因的功能和可能参与的分子调控途径进行了分析.主要结果如下:每个小麦材料平均测出26 498 522条clean reads,67.64%的测序序列能够定位到小麦基因组上;表达基因(RPKM>1)占总数的44.13%.小麦受叶锈菌诱导后,在MuTcLr19 M2-6与TcLr 19中共筛选出差异表达基因(DEGs) 10 671个.
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