南方春大豆种子在生理成熟(R6或R7期)过程中易受高温高湿(HTH)胁迫导致种子收获前恶化,种子活力下降,这已经严重制约了中国南方春大豆生产和应用的发展。本研究以抗种子田间劣变种质湘豆3号和不抗种质宁镇1号为材料,在种子发育到生理成熟至完全成熟期期间模拟田间HTH胁迫处理,运用蛋白质组学技术(iTRAQ),分别研究春大豆叶片、子叶和胚在不同HTH胁迫时间(24、96和168h)的蛋白质表达谱的变化。研究表明HTH胁迫处理(24、96和168 h)后,在湘豆3号的子叶、胚和叶片中分别检测到247,179,517个在处理与对照之间表达量上存在显著差异的蛋白。在宁镇1号的子叶、胚和叶片中分别检测到236,366,479个在处理与对照之间表达量上存在显著差异的蛋白。这些蛋白主要参与胁迫防御,能量代谢,光合作用,蛋白合成,信号转导以及贮藏蛋白等代谢途径和细胞过程,且抗性种质湘豆3号的细胞防御,光合作用和蛋白合成途径呈正向调控,不抗种质宁镇1号的光合作用、信号转导和能量代谢途径呈负向调控。高温高湿胁迫下抗性种质湘豆3号较不抗种质宁镇1号具有较强的光合能力,更加稳定的细胞超微结构,较低的能量消耗,较高的蛋白含量,较强的抗氧化和细胞修复及防御能力。这些可能是其具有较强的抗种子田间劣变性的关键原因。本研究在蛋白水平上揭示了高温高湿下南方春大豆种子田间劣变性和劣变抗性的机制,为遗传育种改良和新品种选育奠定种质基础。