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为了探究柑橘衰退病毒种群分化情况,运用MAFFT、Dnasp等软件分析已完成全基因组测序的22个CTV分离株的p20、p23、p25基因核苷酸序列多样性、核苷酸分散度以及种群遗传分化。分析结果表明分离株中p25基因核苷酸分散度变化小且稳定,p23基因核苷酸多样性最高,NA(北美洲)分离株的p20、p23基因种群内核苷酸分散度和核苷酸序列多样较高,EU(欧洲)分离株较低。ASAF(亚洲和非洲)分离株和来自OA(大洋洲)分离株之间的群体间差异大且基因交流小。