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利用29个微卫星标记对中国31个绵羊品种进行了遗传多样性分析,计算了品种的期望杂合度、观察杂合度、观察等位基因数、有效等位基因数和遗传距离。浪卡子绵羊的平均杂合度最低为0．5276,大尾寒羊的观察杂合度最高为 0．6917。大尾寒羊与乌骨羊的遗传距离最远为1．4488;卡拉库尔羊与柯尔克孜羊的距离最近为0．1153。基于Nei氏(1972) 距离利用PHYLIP软件应用非加权组对算术平均法(UPGMA)构建了系统发生树,结果显示我国31个绵羊品种被聚为四大类。巴什拜羊、多浪羊、策勒黑羊、和田羊、塔什库尔干羊、叶城羊、卡拉库尔羊、柯尔克孜羊、青海黑臧羊、阿勒泰羊、巴音布鲁克、哈萨克羊、青海白藏羊、湖羊、晋中绵羊为第一类;迪庆绵羊、宁蒗绵羊、乌骨绵羊、腾冲绵羊和昭通绵羊为第二类;浪卡子绵羊、郏县大尾羊、豫西脂尾羊、岗巴绵羊、江孜绵羊、安多绵羊和林周羊聚为第三类;小尾寒羊、大尾寒羊、山地绵羊和洼地绵羊聚为第四类。