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中药复方是中医临床用药的主要形式和手段，其独特配伍规律及应用效用的优越性已为数千年的临床实践所证明。但由于其配伍的玄妙和复杂，难以科学地阐明其物质基础和作用机理，对其研究也存在不同的思路与方法。本文对目前中药复方研究存在的问题进行了分析，通过比较分析目前几种中药复方研究的思路和方法，认为中医药的优势在临床，中药复方的优势体现在临床。中药复方多靶点、多途径的整体调节作用的特点决定了必须将中药复方作为一个有机的整体进行系统的研究。中药复方系统研究模式是以临床疗效为中心，以探讨临床疗效的药理研究来探讨中药复方作用机理，以临床和药理研究为基础的化学研究为手段，进而进行相应的制剂研究。这种系统研究模式体现了中药复方的特点。