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生物信息学是一门基于高通量数据分析的科学研究方法,作为高通量数据分析的现代化科学研究工具,生物信息学在医药研发领域起到了重要的作用。将生物信息学的分析方法应用到现代中医药的研发过程当中符合时代科学发展的需要,将这种高通量分析方法与中医药研究有机结合起来,能够为中医药的临床疗效评价及机制研究提供一个可行的途径。本文主要介绍聚类分析、差异基因的功能富集分析以及网络分析三种方法在中医药的个体化给药、药效评价以及机制研究中的应用策略。