为明确我国入侵危险性新病害-芒果畸形病病原菌的种类和遗传多样性,对分离自四川、云南、广西和海南等省区多个生态区域的菌株,通过形态学与特异性引物(1-3F/R、AF1)进行鉴定,并结合Histone H3、EF-1α和β-tubulin基因序列构建系统发育树,比较分析菌株间的遗传多样性与地理区域之间的关系。研究结果表明,我国芒果畸形病病原菌主要为芒果镰刀菌(Fusarium mangiferae)、少量为层出镰刀菌(Fusarium proliferatum);我国多个生态区域的芒果畸形病病原菌的遗传多样性与地理区域有一定的相关性,分离自四川省(22个)、云南省(3个)和广西区(1个)的26个菌株与国外报道的一个F.mangiferae标准菌株聚为1个分支,再与分离白海南省(4个)菌株聚为1个较大的分支,说明分别来自大陆地区和海南的两个畸形病病原菌类群的亲缘关系较远,推测存在不同的传入途径。