随着标准化的法医DNA分型技术及计算机技术的不断成熟和完善,DNA数据库得到了极大的发展。通过DNA数据库进行海量数据的存储、检索和共享,既能够发挥生物遗传学在个体识别上的作用,同时又反过来推动了法医DNA规模化检验技术的发展。近年来,二代测序技术兴起,对遗传学的研究方式产生了巨大影响,各种平台、试剂与技术方法不断涌现,并逐渐进入法庭科学领域。目前,中国公安机关DNA数据库作为世界第一大DNA数据库,已臻成熟,二代测序技术要深入发展,需要借助于DNA数据库推广应用,两者的兼容性问题凸显。本文介绍了中国公安机关DNA数据库的现状,综述了二代测序的技术优势及其在法医DNA检验与DNA数据库上的应用,并探讨了二代测序数据与中国DNA数据库的数据存储一致性和数据比对兼容性方案。