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传感器量测时间等因素的变化会产生变长度量测序列数据组，为了研究长度变化对变长度量测序列数据中的不等长序列数据关联的影响，结合一种不等长度序列相似度的度量方法进行仿真分析，并采用最大相似度关联准则对不等长度序列的相似度进行关联判定。仿真试验验证了算法的有效性，得知序列相似度随着窗口序列长度的增加而增大，窗口长度设定为较长序列长度的30％～40％附近效果最优。