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【目的】探讨太湖土著藻毒素降解菌降解藻毒素的特性、降解过程中涉及的关键基因以及藻毒素被菌降解的途径和降解产物,为揭示藻毒素降解机制和构建藻毒素降解新技术提供科学依据。【材料和方法】通过菌株形态、生理生化特征、16S rDNA序列比对对藻毒素降解菌进行鉴定;探讨外界环境条件对菌降解藻毒素效率的影响,利用高效液相色谱-飞行时间质谱联用技术测定藻毒素浓度和分析藻毒素被藻毒素降解菌降解过程中所产生的降解产物;将降解菌加入太湖蓝藻堆积池水样中,测定藻毒素降解菌对自然水体中的藻毒素的降解效率;设计特异性引物,PCR扩增获得藻毒素降解过程中的关键酶基因。【结果】筛选得到的土著藻毒素降解菌MC-LTH1和MC-LTH2分别属于博德特氏菌属(Bordetella sp.)和寡养单胞菌属(Stenotrophomonas sp.);菌株MC-LTH1对MC-LR和MC-RR的降解速率可分别高达2.8 mg/(L·d)和5.3 mg/(L·d),对蓝藻堆积池水样中的MC-LR和MC-RR的平均降解速率分别为0.08 mg/(L·h)和0.12 mg/(L·h);MC-LTH1降解藻毒素的降解产物的质子化离子([M+H]+)的精确分子量分别为1013.563,1056.4970,615.3394和332.2215。藻毒素降解菌MC-LTH1扩增的条带大小为806bp,与鞘氨醇单胞菌C-1的mlrA基因序列相似性均高达99%;菌株MC-LTH2对MC-LR和MC-RR的降解速率可高达3.0 mg/(L·d)和5.6mg/(L·d),对蓝藻堆积池水样中的MC-LR和MC-RR的平均降解速率为0.09mg/(L·h)和0.14 mg/(L·h),MC-LTH2降解藻毒素的主要降解产物的质子化离子的精确分子量为332.2220。【结论】成功筛选得到高效土著藻毒素降解菌Bordetella sp.MC-LTH1和Stenotrophomonas sp.MC-LTH2,两株藻毒素降解菌均能对太湖蓝藻堆积池水样中MC-LR和MC-RR进行高效降解;Bordetella sp.MC-LTH1中含有mlrA同源基因;MC-LTH1降解藻毒素可得到中间产物有线型MC-LR(C49H76N10O13)、线型MC-RR(C49H77N13O13)、四肽(C32H46N4O8)和Adda(C20H29NO3)等中间产物;菌株MC-LTH1和MC-LTH2能将藻毒素生物活性表达所必需的基团Adda及含Adda基团的化合物彻底降解,具有高效解除藻毒素MC-LR和MC-RR毒性的作用和功能。