梨抗黑斑病SNP标记及候选基因筛选

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梨黑斑病是我国梨生产上危害最严重的病害之一,在南方砂梨产区危害尤其严重。本研究以抗黑斑病品种翠冠、感黑斑病品种早酥为亲本,以"双假侧交"法构建F1群体。通过抗性评价,筛选得到高抗黑斑病F1单株27株,高感黑斑病F1单株35株。通过BSA分析方法,分别以高抗、高感F1单株构建抗感基因池,应用SLAF测序技术,开发SNP标记,进而通过SNP-index关联分析,得到77个与抗黑斑病相关联的SNP标记。对关联SNP标记前后50kb范围内基因进行功能注释,并结合PHI数据库比对分析,筛选得到候选基因18个。进一步对亲本进行重测序辅助定位,分析得到抗黑斑病相关基因55个,通过与PHI数据库比对,筛选得到16个候选基因。其中BSA分析与重测序筛选筛选的到的候选基因组有3个基因重合。功能注释结果显示这3个基因分别与拟南芥抗霜霉病基因ADR1-L1、ADR1-L2,水稻抗稻瘟病基因MAC1同源,可能为梨抗黑斑病相关基因。
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