河北省6个黑猪群体的遗传多样性分析

来源 :河北农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kensenwey
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河北省是中国地方猪的起源地之一。随着社会经济的发展,这些地方猪品种逐渐衰亡,只有少量黑猪零散分布。近年来,随着特色畜产品的兴起,河北省的黑猪养殖规模有所增加,但迄今为止,对于河北省地方猪遗传资源现状缺乏了解和研究。为了解河北省黑猪群体养殖状况及遗传资源多样性现状,以便更有效地对地方猪品种资源开展保护和开发利用。从2014年起,对河北省黑猪群体状况开展调查,采用分层随机抽样法采集了6个县(石家庄辛集、保定易县、唐山遵化、廊坊霸州、张家口沽源、承德围场)的黑猪样品。利用微卫星标记及mtDNA D-loop区两种分子标记对河北省6个黑猪群体的遗传多样性进行分析。  在调查中发现,河北省境内黑猪群体普遍规模较小,纯种公猪数量极少,血统不清,群中杂种个体多,但在体型外貌上与地方猪相似。  微卫星位点研究结果显示河北省6个黑猪群体共计152个个体在27对微卫星位点中共检测到247个等位基因,平均每个微卫星位点上的等位基因数为9.15个,等位基因数最多的位点为S0068,等位基因数有13个,等位基因数最少的位点为S0002,只有1个等位基因;27个微卫星位点在6个群体中的观察等位基因数在1~12范围之间,有效等位基因数在1.0000~9.8462范围之间,有效等位基因数低于观察等位基因数,说明等位基因在群体中的分布不均匀;6个群体的观察杂合度(0.1747~0.3090),期望杂合度(0.5285~0.7591),多态信息含量(0.5029~0.7275),说明黑猪群体具有丰富的遗传多样性。F-统计量结果显示6个群体中在27个微卫星位点的Fis、Fit均大于0,说明6个黑猪群体内有不同程度的近交;Fst值为0.1528,说明6个黑猪群体的分化程度较高。  mtDNA D-loop的研究结果显示6个黑猪群体的mtDNA D-loop区A+T(55.25%)显著高于C+G(44.73%)含量;比对后共发现53个变异位点,31种单倍型;单倍型多样性和核苷酸多样性的范围在0.523~0.910、0.00056~0.00730,说明群体有较丰富的遗传多样性;Fst在-0.008~0.246范围之间,其中群体1和3、群体2和3、群体2和4、群体3和4分化指数为负数以及群体1和2、群体3和5接近0,说明群体内部的差异要大于群体间的差异,其他群体间的遗传分化指数较高。  在对6个黑猪群体的分析结果基础上,提出群体1、4、6可扩大血统数以延缓群体的近交状态,由于群体2、3、5较杂,可开展针对性选育,提高群体的一致性。  由以上研究结果得出以下结论,发现的河北省黑猪养殖规模较小,群体较杂,公猪少,血统来源不清;使用两种分子标记均说明河北省6个黑猪群体的遗传多样性丰富,遗传分化程度较高。
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