收入分配差距的日益扩大，尤其是不同所有制企业间的收入差距问题是当今中国经济社会发展亟需解决的问题之一，关乎全面建设小康社会目标的实现，协调和处理好不同收入层次之间的工资差距问题显得非常重要。我们基于2013年中国综合社会调查（CGSS）的微观调查数据，首先对数据进行统计性描述，给出一个大致的分配状况，其次对工资决定方程进行修正——选择偏差修正模型，在工资决定方程和分解方程的基础上构建修正模型，最后采用 OLS和分位数回归以及对应的分解模型对两部门间的工资差异问题进行实证分析，结果表明：　　（1）国有部门和非国有部门之间的人力资本特征存在着较大的差距，是造成两部门之间工资差异的重要因素之一；（2）Oaxaca-Blinder分解的结果显示，国有部门工资水平显著高于非国有部门，且大部分是由于人力资本特征差异所造成的；（3）从影响国有部门和非国有部门工资差异的各个影响因素的角度上看，各有侧重，国有部门更加注重职工的文化水平，非国有部门更注重职工的工作经验；（4）分位数分解的结果显示，随着收入水平的不断提高，国有部门和非国有部门的工资差异总值以及分解的特征差异、系数差异以及残差项均呈现出下降的趋势，且下降的程度远远小于总差异水平。这表明不同收入层次的工资差距问题的严重程度不同，低收入水平和中等收入水平相对于高收入水平工资差距矛盾突出。其中特征差异为正值，且所占总差异的比重非常高，而系数差异为负值且占比非常低，这表明我国国有部门和非国有部门的工资差异问题严峻的背后因素主要在于人力资本投资的不同，国有部门和非国有部门的企业性质不但不是差距扩大的助力，反而在一定程度上缩小两部门间的工资差距，并从补偿性工资差异理论的角度解释了工资溢价为负数的原因。　　为了能够解决好目前收入分配制度中所存在的问题，需要对收入分配制度做出相应的调整，以实现社会公平，促进国民经济的持续健康发展。本文给出的建议是从企业对待员工人力资本特征的偏好、注重人力资本投资和不同收入水平制定不同的收入分配政策三个角度进行阐述，逐步实现收入分配领域的公平公正。