分子形貌理论应用于原子间成键过程的动态变化的研究

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分子形貌理论不仅能够精确地描绘出所选分子体系的形状和大小,同时能够形象生动地显示出分子的表面电子密度及特征。本文应用分子形貌理论,分别探讨了双原子体系和三原子体系成键过程的形貌动态变化。对成键过程进行了科学可视化,用静态漫画的方式和动画演示这两种方式描述分子形貌图变化的过程。具体的研究内容如下:(1)对于双原子体系分别研究了:H-F体系两原子由远到近成键过程、Li-F体系两原子由远到近成键过程的形貌动态变化,使用MP2/6-311++G(d,p)的基组和理论方法,计算获得H-F、Li-F体系成键过程的第一电离能。利用MELD软件包,结合自编程序,在hf/6-311++G(d,p)理论水平下,计算得到各个核间距下体系单电子作用势。计算了分子平面内禀特征轮廓点到原子核距离以及界面对应的电子密度,并且绘制了各体系的分子形貌图。(2)对于三原子体系分别研究了:O原子沿着H2分子的H-H键方向由远到近进攻H2分子过程、O原子沿着垂直于H2分子的H-H键且经过H-H键键心的直线由远到近进攻H2分子形成H2O分子过程,在MP2/6-311++G(d,p)的基组和理论方法下,计算获得两种进攻过程中各个体系的第一电离能。使用MELD精密从头计算中的hf/6-311++G(d,p)方法,结合我们自编的分子形貌程序,计算分子中一个电子作用势的大小,进而获得分子各个内禀特征值以及这些值对应的边界电子密度,并绘制出分子形貌图。(3)围绕“科学可视化”这一主题。主要体现为两种形式:利用SAI等绘图软件,结合HF分子成键的分子形貌图变化,绘制漫画。利用PS等做图软件对HF分子成键和H2O分子形成的形貌平面图进行修改和整合,以动画的形式展示出来。这两种方法都能够与理论计算结合起来,更加直观和形象地展现出分子成键时分子形貌的变化,同时也能让更多人对理论计算产生兴趣,体验化学科学的魅力。本文通过分子形貌理论,对分子的成键过程提供了更直观的认识。结合图像和动画,对研究分子成键过程也有了一种崭新的方向和认知。
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