探讨酵母菌中与RPL36A和RPL36B重叠的LncRNAs的生理功能

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RPL36A与RPL36B是酿酒酵母59对双拷贝核糖蛋白基因之一。在RPL36A和RPL36B的反义链上都有一个反义lncRNA。AO193与RPL36A的内含子很大部分重叠。BO250与RPL36B的第二个外显子重叠。有研究表明反义lncRNA在调节基因表达方面有重要作用。为了明确AO193和RPL36A、BO250和RPL36B的关系。本文通过对在不同条件下野生型FY251中这四个基因的转录水平的变化发现在不利于细胞生存的条件下,RPL36A和RPL36B的转录水平都有明显的下降,但AO193和BO250的转录却是上调的。这说明在应对恶劣条件时AO193和BO250对细胞的生存是有价值的。而且就长时间培养的FY251而言,随着时间的推移,后期FY251中RPL36A和RPL36B的转录水平和AO193和BO250的转录水平呈正相关。为了明确RPL36A、RPL36B、AO193和BO250四者的关系。我们首先分析了RPL36A和RPL36B的关系,RPL36A与RPL36B是双拷贝同源基因。当敲除RPL36A对RPL36B没有影响,但敲除RPL36B对RPL36A的转录水平会显著上调。即使增加RPL36A的转录,RPL36B的转录水平也不会发生明显的变化。说明RPL36A和RPL36B的功能存在很大的差异,并且他们之间存在相互协调作用。随后通过荧光定量PCR检测不同改造的菌株中RPL36A、RPL36B、AO193和B O250四者转录水平的关系。结果表明RPL36A和AO193在转录层面呈正关。R PL36B和BO250的关系比较复杂,目前结果还未能厘清。为了探索AO193和BO250的功能,我们通过将其构建在质粒上高量表达A O193和BO250用于观察其对RPL36A和RPL36B的影响。结果表明高量表达A O193对RPL36A的转录没有显著的影响。但对RPL36B的转录是有些促进作用。BO250在正常情况下高量表达对细胞的影响并不能显现,而且BO250和AO193之间也并不是独立的,BO250会抑制AO193的转录。接着我们通过改造基因结构降低了AO193和BO250的转录,结果表明RPL36A和RPL36B的转录都显著下降了。但将AO193和BO250分别构建在质粒上,转入到突变菌中后只有RPL36A-flag,RPL36B-ADH1t/p195-BO250的生长恢复到和野生型一样。根据以上结果我们推测BO250的功能可能是在应对胁迫条件而激发用于维持RPL36A和RP L36B正常功能的。从RPL36A和RPL36B的mRNA和蛋白表达情况我们可以看出,BO250对其的影响比不是从转录和翻译层面进行的。而更有可能是像伴侣蛋白一样是通过维持RNA的正确修饰和剪切或是维持蛋白的正确修饰和折叠等方面起作用的。或是作为一种核糖体因子维持核糖体生物合成的正常进行。
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