近年来，违章建筑的纠纷在法律实务中越来越多，目前在立法上没有对违章建筑进行明确清晰的界定，诸多立足于公法视角对违章建筑进行调整，以行政手段完全取代民事手段的现象十分严重。违章建筑引起的民事纠纷各个法院处理各不相同，当事人的合法私有权利没有得到相应的保护，在理论界也引发了颇多争论。处理有关违章建筑民事纠纷案件的核心在于正确认识违章建筑的私法性质，摆正公权力和私权利的关系，坚持私法独立，保护当事人的正当权益。本文通过相关法理研究，主要围绕违章建筑权属问题，从违章建筑的界定、民法性质、民事纠纷表现形式和民事纠纷的应然解决方式进行论述。笔者认为违章建筑在未被相关行政机关所认定其违章性前建造人应当享有所有权，并从私法的角度着重探讨了涉及违章建筑的相关民事纠纷的表现形式及解决方式，为妥善处理与违章建筑相关的民事纠纷提供法理依据，以期能适当解决若干理论争论，在实务上提供某些建议。同时提出要重视司法意见书的作用，也从民事上辅助行政机关坚决打击违章建筑，真正地稳定社会秩序，维护司法公正。