我国医药物流行业的快速发展使得医药整合的力度不断地增加，大型医药物流中心的规划与建设成为了发展现代化医药物流的必然趋势。因此，建立医药物流中心成为我国大型医药物流行业发展的重点。但是我们必须认识到物流中心的建设具有投资大、回收期长的特点，而且一旦建成，更改非常困难，盲目地建设、缺乏详细的规划会造成运营后很多问题。因此，如何做好物流中心仓库布局和流程规划，保证仓库系统有序运作成为重中之重。物流系统仿真技术的发展为仓库系统的优化设计提供了一种有效地方法，它借助计算机等技术，对现实的仓库系统进行模拟，通过分析仿真结果，优化瓶颈因素，减少仓库在布局和参数设置上的不合理，最后确定合适的方案，提高了仓库作业效率，降低了整个仓库系统的投资成本。本文以实习的一家医药物流企业A公司物流仓库作业系统为研究对象，为了满足医药行业市场规模的扩大和第三方医药物流业务需求的增加，A公司投资5800万元，建成了仓库面积达15276平方米的物流中心。为了保证物流中心仓库作业系统的顺利运行，本文首先对A公司物流中心仓库作业系统流程和布局进行了深入的分析，并运用Flexsim系统仿真软件对其仓库作业系统进行仿真建模，通过分析仿真结果，找到影响物流中心仓库作业系统的瓶颈因素，分析其存在的可能原因，并对其中的一些布局和参数进行优化调整，重新建立优化方案仿真模型，运行并输出仿真结果，对比分析优化前后的仿真效果，验证优化方案的合理性。为医药物流行业仓库作业方案的评估和改进提供了参考，也为作业流程的布局优化和资源配置提供了借鉴。