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本实验以扬州鹅为素材,对鹅胰岛素样生长因子-Ⅰ(IGF-Ⅰ)基因组部分序列进行了克隆、测序,并用PCR-SSCP的方法对其多态性进行了检测。主要结果如下:
1.得到了鹅IGF-Ⅰ基因的5调控区、外显子l、4及内含子1、3的全部或部分序列,所测序得到的内含子1、内含子3和外显子4序列已上传至Genbank,序列号分别为EU07203l、EU111743。本研究首次得到了鹅IGF-Ⅰ基因的内含子1和3序列。序列比对发现,鹅IGF-Ⅰ基因与鸡、鸭同源性较高,无论是外显子还是内含子都大于80%(除内含子3),外显子1与鸡、鹌鹑、火鸡、鸭、鸵鸟、鹅等禽类同源性在98%以上,与梅花鹿、山羊、猪、牛、北极狐、绵羊、小鼠和人等哺乳动物同源性在89%~94%之间,与乌颊鱼、罗非鱼的同源性在60%~65%之间。对鹅5调控区和外显子1序列进行转录因子结合位点和启动子区域预测,发现有多个结合位点和一个启动子区域。进化分析表明IGF-Ⅰ基因的进化与物种进化相一致,反映了IGF-Ⅰ基因在进化中的保守性及生理功能的重要性。
2.根据鹅IGF-Ⅰ基因的5调控区、外显子1和内含子1部分序列设计了7对引物,用PCR-SSCP的方法对其进行单核苷酸多态性(SNP)检测。结果未发现多态性。