马奶酒样乳杆菌基因组分析及WANG1296基因的初步研究

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本实验室前期从西藏传统乳制品Kefir粒中分离得到一株具有高产胞外多糖特性的马奶酒样乳杆菌ZW3,该菌具有很好的益生和发酵性能,其胞外多糖最高产量达1600mg/L,产生的胞外多糖具有良好的结构和理化性质,是一株可用于多种领域的非常有前途的菌种。本课题以马奶酒样乳杆菌ZW3为研究对象,对其全基因组测序得到的测序结果进行分析,该菌株包含一个2.11Mb的环状染色体以及两个大小分别为194,769bp(pWWl)和46,296bp (pWW2)的质粒,染色体的GC含量为37.70%,含有1,908个蛋白编码序列CDSs)。质粒pWW1的GC含量为33.98%,含有199个CDSs;质粒pWW2的GC含量为36.02%,含有55个CDSs。ZW3基因组含有一段14.4kb的eps基因簇,含有17个多糖编码相关基因。对这17个多糖编码的相关基因进行同源性比对分析,发现其中含有八个转移酶基因、三个调节基因、一个链长调节基因、两个运输相关的基因,其余基因属于未知基因。以马奶酒样乳杆菌ZW3染色体为模板,设计引物扩增其eps基因簇中的17个基因(WANG1283-WANG1299),成功将其中八个基因插入质粒pMG36e中,构建了乳酸菌重组表达载体,将构建成功的重组表达载体逐一转化至另一株产胞外多糖的乳酸乳球菌WH-C1中,对得到的五株重组乳酸乳球菌WH-C1及野生菌测定其生长特性,发现突变子与野生菌之间及突变子之间的生长速度与总的生物量上存在一定的差异。针对前期对eps基因簇中各个基因的分析比对结果,选择WANG1296基因进行下一步的功能研究,与该基因同源性较高的几株菌中认为该基因所编码的蛋白为酪氨酸蛋白磷酸酶;对该基因进行生物信息学分析,该基因可编码由256个氨基酸组成的蛋白,其编码的WANG1296蛋白包含有一个metallo-dependenthydrolases结构功能域和一个CapC多功能位点,为一疏水性蛋白,无跨膜螺旋,没有信号肽,属于非分泌型胞内蛋白。根据SDS-PAGE电泳图谱可初步确定WANG1296基因在乳酸乳球菌WH-C1中成功进行了蛋白表达,然后利用苯酚-硫酸法测得重组乳酸乳球菌WH-C1/pM G36e-WANG1296的胞外多糖产量是野生菌的1.8倍,胞外多糖产量有了明显的提高。通过本实验的结果分析,及参考文献报道,认为WANG1296基因对胞外多糖的合成起促进作用,与基因组测序结果中认为WANG1296基因是胞外多糖合成有关的基因结果相符。
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